Cada transformación
química implica un cambio en la conectividad de los átomos. Se rompen
algunos enlaces y se forman otros nuevos. La quimica organicase
interesa no sólo por los reactivos y los productos de una reacción,
sino también por los detalles, especialmente el orden de los procesos de
rotura y formación de enlaces. También se interesa por el estudio de
las velocidades de reacción y se investigan cómo la velocidad y los
productos varían en función de las condiciones experimentales.
También explora los cambios estereoquímicos que ocurren durante la reacción. A partir de observaciones como éstas, se postulan los detalles del proceso o camino que los reactivos siguen durante su transformación en productos. Este camino de reacción se llama mecanismo de la reacción.